Iniciación
La
holoenzima RNA-polimerasa se encuentra con la secuencia promotora, se forma el
complejo promotor cerrado y la afinidad de esta unión es muy alta.
A
continuación la propia RNA polimerasa se desenrolla mediante una isomerización
dependiente, la separación de las cadenas se extiende y el DNA se curva
fuertemente en forma de U en la RNA-polimerasa y se empieza a formar la burbuja
de transcripción. Se necesitan las topoisomerasas I y II para controlar el
superenrollamiento en las zonas de transcripción.
Elongación
El avance de la Polimerasa no es continuo, si no a saltos por lo que se llama avance en forma de gusano.
Este avance en gusano es retrasado debido a que durante la elongación se producen numerosas paradas porque hay secuencias que se transcriben peor que otras. En estas paradas, la RNA-polimerasa retrocede unos nucleótidos, de manera que el extremo 3’ del RNA naciente queda protuberante y sin aparear, lo cual impide que se pueda seguir transcribiendo.
Cuando la RNA-polimerasa se acerca a la región terminadora, pasa sobre una secuencia denominada nut que sirve para incorporar a la polimerasa central la subunidad NusA. Lo que provoca un aumento inespecífico de paradas durante la polimerización, lo que facilita la terminación de la transcripción.
Se necesita dos regiones ricas en G-C simétricas y complementarias con lo que se puede formar una horquilla, seguidas de una región rica en A. Al llegar a las secuencias ricas en
G-C, la RNA-polimerasa con NusA reduce su velocidad, dando tiempo para que el transcrito pueda formar la horquilla y deshaciendo la interacción con HBS.
G-C, la RNA-polimerasa con NusA reduce su velocidad, dando tiempo para que el transcrito pueda formar la horquilla y deshaciendo la interacción con HBS.
Cuando la enzima pasa sobre la secuencia rica en A, el híbrido DNA-RNA es muy débil y se disocia.
http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/animations/animations.htm Síntesis de proteínas.