Iniciación
La
holoenzima RNA-polimerasa se encuentra con la secuencia promotora, se forma el
complejo promotor cerrado y la afinidad de esta unión es muy alta.
A
continuación la propia RNA polimerasa se desenrolla mediante una isomerización
dependiente, la separación de las cadenas se extiende y el DNA se curva
fuertemente en forma de U en la RNA-polimerasa y se empieza a formar la burbuja
de transcripción. Se necesitan las topoisomerasas I y II para controlar el
superenrollamiento en las zonas de transcripción.
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Elongación
El avance de la Polimerasa no es continuo, si no a saltos por lo que se llama avance en forma de gusano.
Este avance en gusano es retrasado debido a que durante la elongación se producen numerosas paradas porque hay secuencias que se transcriben peor que otras. En estas paradas, la RNA-polimerasa retrocede unos nucleótidos, de manera que el extremo 3’ del RNA naciente queda protuberante y sin aparear, lo cual impide que se pueda seguir transcribiendo.
Cuando la RNA-polimerasa se acerca a la región terminadora, pasa sobre una secuencia denominada nut que sirve para incorporar a la polimerasa central la subunidad NusA. Lo que provoca un aumento inespecífico de paradas durante la polimerización, lo que facilita la terminación de la transcripción.
Terminación
Se necesita dos regiones ricas en G-C simétricas y complementarias con lo que se puede formar una horquilla, seguidas de una región rica en A. Al llegar a las secuencias ricas en
G-C, la RNA-polimerasa con NusA reduce su velocidad, dando tiempo para que el transcrito pueda formar la horquilla y deshaciendo la interacción con HBS.
G-C, la RNA-polimerasa con NusA reduce su velocidad, dando tiempo para que el transcrito pueda formar la horquilla y deshaciendo la interacción con HBS.
Cuando la enzima pasa sobre la secuencia rica en A, el híbrido DNA-RNA es muy débil y se disocia.
http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/animations/animations.htm Síntesis de proteínas.
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