miércoles, 22 de febrero de 2012

FORMAS DEL ADN


RESUMEN
El ADN es la sustancia química donde se almacenan las instrucciones que dirigen el desarrollo de un huevo hasta formar un organismo adulto, que mantienen su funcionamiento y que permite la herencia. Es una molécula de longitud gigantesca, que está formada por agregación de tres tipos de sustancias: Azúcares, llamados desoxirribosas, el ácido fosfórico, y bases nitrogenadas de cuatro tipos, la adenina, la guanina, la timina y la citosina. Cuando hablamos del ADN, nos estamos refiriendo al núcleo central que controla todo el metabolismo de célula, contiene y guarda el material genético y es capaz de copiarse así mismo.                                                                                       El ADN lo podemos encontrar en varias formas dependiendo la naturaleza: Por ejemplo la forma ADN- A, ADN- B, ADN -Z entre otras. La forma más común es la forma ADN-B  propuesta por Watson y Crick.                                                                                                          En este trabajo se presentaran diferentes formas biológicas en las que podemos encontrar el ADN, y así mismo podremos observar sus características biológicas y las diferencias que presentaran entre ellas.

SUMMARY
The DNA is the chemical that stores the instructions that direct the development of an egg to form an adult organism, which maintain their operation and allows inheritance. Is an enormous length molecule, which is formed by aggregation of three types of substances: sugars, called deoxyribose, phosphoric acid, and four types ofnitrogenous bases, adenine, guanine, thymine and cytosine
When we talk about DNA, we are referring to the core that controls the metabolism ofcells, containing genetic material and stores and is able to copy likewise. The DNA can be found in various forms depending on the nature: For example howDNA-A,-B DNA, DNA-Z among others. The most common is the B-DNA proposed byWatson and Crick.                                                                                                                                In this paper we present different biological forms in which we find the DNA, and so itcan observe its biological characteristics and differences present between them.

ÍNDICE

                                                                                                 Página

1. Antecedentes                                                                           4
2. Definición del problema                                                          5
3. Objetivo (s)                                                                                5
    3.1. General                                                                               5
    3.2. Específico                                                                          5
4. Justificación.                                                                             6
5. Fundamento teórico.                                                                6
6. Materiales y Métodos.                                                             8
7. Resultados.                                                                               8
8. Conclusiones y Recomendaciones.                                      10
9. Fuentes consultadas.                                                              10
10.  Anexos.                                                                                  11


  
                                                           1. ANTECEDENTES

Después de que el papel central del DNA en la herencia se hizo evidente, muchos científicos se dispusieron a determinar su estructura con exactitud. Ellos se preguntaban. ¿Cómo puede una molécula con un rango tan limitado de componentes distintos almacenar la inmensa variedad informativa de las estructura de todas las proteínas de los seres vivos?
Los primeros que tuvieron éxito en descubrir la estructura fueron Watson y Crick en 1953- tuvieron en cuenta dos tipos de pistas.
En primer lugar, Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, habían acumulado muchos datos de difracción de rayos X sobre la estructura de DNA.
El segundo tipo de datos procedía del trabajo de años antes de Edwin Chargaff. Estudio DNA de diferentes organismos. Erwin Chargaff analizó la composición de bases de distintos organismos y encontró distintas proporciones de los 4 nucleótidos en cada uno de los organismos estudiados. También observó que esta composición no cambiaba con la edad ni el ambiente. Pero lo más importante es que había tantas purinas como pirimidinas en todos los organismos.
En los primeros análisis de difracción de R-X realizados por Rosalyn Franklin se observaba que el DNA tenía un espaciado regular de 0,34 nm. Éste y otros indicios indicaban que debe tener algún tipo de estructura en hélice que se repite periódicamente, los datos sugerían que el DNA era largo y fino y que consta de dos partes separadas que corre una al lado de la otra a lo largo de la molécula, también demostraba que la molécula era helicoidal.
Watson y Crick construyeron un modelo que cumpliera todas las investigaciones que sobre el DNA se habían realizado hasta la fecha y propusieron, además, cómo tenía que conservarse y transmitirse la información de esta molécula. También introdujeron que esta molécula se podía mutagenizar espontáneamente mediante la tautomería.
Por lo general, el ADN se presenta bajo la forma B, pero ya Watson y Crick observaron que en  condiciones de moderada deshidratación podía adoptar la organización espacial A.
Watson y Crick describieron el modelo de las formas A y B del ADN mediante la interpretación de fotografías de difracción de rayos X obtenidas de fibras de ADN nativo, es decir, extraído de células. Sin embargo, la magnitud de la información que puede obtenerse de este tipo de estudios es limitada, debido a que las fibras de ADN son extremadamente largas, no cristalizan y habitualmente presentan un cierto desorden estructural. Y es por ello, que ellos llegaron afirmar que existen más formas biológicas en las que podemos encontrar el ADN.

                                                  2. DEFINICIÓN DEL PROBLEMA
Conociendo la estructura del ADN, ahora queremos saber, si existen otras formas biológicas en la que podemos encontrar a esta molécula, porque son importantes, y que características presenta cada forma biológica encontrada.

3. OBJETIVOS
3.1. OBJETIVO GENERAL

Que el estudiante adquiera familiaridad con la biología molecular, que descubra que además de la forma A, B y Z, existen muchas formas biológicas en las que podemos encontrar el DNA y las implicancias de esto para la expresión y la vida, también se busca que se usen los recursos web y las TIC´s.

3.2. OBJETIVOS ESPECIFICOS
·         Conocer  y describir cuáles son esas formas biológicas en las que se van a presentar la molécula del ADN.
·         Identificar cuáles son las características que las van a diferencias de las demás moléculas, y que funciones van a presentar.
·         Comprender la importancia de cada una de las formas encontradas.

4. JUSTIFICACIÓN
Esta investigación, nos beneficia a nosotros los estudiantes, y está hecha con el fin para que nos familiaricemos con las formas biológicas del ADN encontradas. Ya que en él se describen estas formas, mencionando sus características y la importancia que presentan.

5. FUNDAMENTO TEÓRICO
Consultando diversas bibliografías se encontraron las siguientes formas biológicas del ADN:

·         ADN-C: 
ADN con 66% de humedad, se obtiene en presencia de iones Li, muestra 9+1/3 pares de bases por giro completo y 19 Å de diámetro.

  • ADN no-B
El ADN es una molécula que se mueve continuamente, se pliega como haciendo gimnasia y baila.
  • ADN-Z
La forma Z es una forma de doble hélice levógira (con giro hacia la izquierda) con una conformación del esqueleto en zig-zag (menos lisa que la forma ADN-B). Sólo se observa un surco, semejante al surco menor, el emparejamiento entre las bases (que forman el surco mayor -cercano al eje- en la forma ADN-B) está hacia un lateral, en la superficie exterior, lejos del eje. Los grupos fosfato se encuentran más cerca entre ellos que en la forma ADN-B. El ADN-Z no puede formar nucleosomas.

  • ADN cruciforme y ADN horquilla
Las estructuras de Holliday (formadas durante la recombinación) son estructuras cruciformes. Las repeticiones (palíndromos) invertidas (o especulares) de segmentos de polipurinas/polipirimidinas también pueden formas estructuras cruciformes o en horquilla mediante la formación de emparejamientos intracatenarios.

  • ADN-H o ADN tríplex
Las repeticiones invertidas (palíndromos) de fragmentos de ADN de polipurinas/polipirimidinas pueden formar estructuras tríplex (hélices triples). De esta manera se forma una hélice triple junto a una cadena monocatenaria de ADN.
El ADN-H puede tener un papel funcional en la regulación de la expresión génica y sobre los ARNs (por ejemplo, en la represión de la transcripción).

  • ADN-G4
El ADN-G4 o ADN cuádruplex: se forma una estructura altamente estable por el plegamiento de una secuencia bicatenaria rica en GC consigo mismo a través de emparejamientos de Hoogsteen entre 4 guaninas ("G4"). Este tipo de ADN se encuentra a menudo cerca de promotores de genes y en los telómeros.
Tiene un papel en la meiosis y en la recombinación, pueden ser elementos reguladores.

  • ADN con enrollamiento paranémico
Las dos hélices se pueden separar por traslación, cada hélice tiene segmentos alternantes dextrorsos y sinistrorsos de unas cinco bases. Uno de los principales problemas del modelo de la doble hélice (ADN-B) es el enrollamiento plectonémico, para separar las dos hélices es necesario girarlas como un sacacorchos, siendo necesario un gran aporte energético.

  • ADN Palíndromos
Plegamiento o apareamiento de una hélice consigo misma. El palíndromotambién es una figura gramatical que se lee igual en los dos sentidos, por ejemplo: DABALE ARROZ A LA ZORRA EL ABAD. Existe ADN palindrómico de hélice sencilla y de hélice doble. En el palíndromo de doble cadena la secuencia de bases se lee igual en dirección 5’ P→ 3’OH en ambas cadenas.

  • ADN cuadruplexo
"In vitro" se han obtenido cuartetos de Guanina (ADN cuadruplexo) unidas mediante enlaces tipo Hoogsteen, empleando polinucleótidos que solamente contienen Guanina (G). Los extremos de los cromosomas eucarióticos (telómeros) tienen una estructura especial con un extremo 3' OH de cadena sencilla (monocatenario) en el que se repite muchas veces en tandem  una secuencia rica en Guaninas. Se piensa que el ADN cuadruplexo telomérico serviría para proteger los extremos cromosómicos de la degradación enzimática. Ejemplo de secuencia telomérica rica en guaninas (G)

6. MATERIALES Y MÉTODOS

Considero que para la realización de esta investigación se utilizo el método de investigación y el descriptivo; ya que se hizo una revisión a fondo del tema tratado, se citaron diferentes fuentes bibliográficas, libros, enciclopedias, y páginas en internet, para poder recabar información necesaria y poder realizar el trabajo. Para esto, se tuvo que seguir una serie de pasos de cómo debería estar estructurado la investigación, ya teniendo el trabajo terminado en Word, pasamos a enviárselo al profesor al correo, y después publicarlo en el blog. Y para la realización de mi trabajo, necesite tiempo anticipado para realizarlo adecuadamente, la computadora, libros y empeño suficiente para terminarlo.

7. RESULTADOS
Estas fueron las formas biológicas encontradas del ADN:

                                                    



    Fig 1. ADN-A, B, Z                                                                     Fig 2 ADN

               
  
Fig 3: ADN cruciforme y ADN horquilla










Fig 4: ADN-H o ADN tríplex                                                  Fig:5  ADN-G4



Fig 6: ADN con enrrollamiento paranémico Palíndromos paranémico   




 Fig 7:  ADN Palíndromos ADN Palíndromos paranémico    




Fig 8:  ADN cuadruplexo ADN cuadruplexo




8. CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES

En conclusión se puede decir que se cumplieron con los objetivos planteados de la investigación, ya que al realizar este trabajo, me familiaricé con las distintas formas de ADN en que se encentran, también conocí algunas características y algunas de las funciones que desempeñaba. Los resultados que se obtuvieron fueron los esperados, es decir, ya se sabía que se pudiera encontrar  diferentes formas biológicas del ADN.
Gracias a esta investigación uno como persona tiene los conocimientos necesarios para poder identificar qué tipo de ADN existen y que función desempeña cada una de las formas.
Se recomienda leer este trabajo para identificar las diferentes formas biológicas en las que se presenta el ADN. Y que quede como antecedentes para trabajos a futuro.

9. FUENTES CONSULTADAS
Páginas en internet:
Páginas encargadas con relación a genética para consulta de personas a elaborar trabajos de investigación.
Libro:
Benjamin M Lewin 1996 Genes: 1 Volumen 1 de Genes, Reverte, 


                                                    10. ANEXOS
Este anexo es un libro muy bueno que contiene información sobre las formas biológicas del ADN.

Título
Adn/ Dna
Colección Ciencias
Autor
Torsten Krude
Editor
Ediciones AKAL, 2008
ISBN
8446022664, 9788446022664
N.º de páginas
200 páginas.

martes, 21 de febrero de 2012

INSTITUTO TECNOLOGICO DE CD. ALTAMIRANO GRO



LIC: BIOLOGIA

MATERIA:
BIOLOGIA MOLECULAR


“INVESTIGACIÓN SOBRE
FORMAS DEL ADN”


NOMBRE DE LA ALUMNA:

ALEXA MOLINA VALENZUELA
09930047



SEMESTRE Y GRUPO:
Vl SEMESTRE “A”

NOMBRE DEL PROFESOR:
FRANCISCO JAVIER PUCHE ACOSTA

CD.ALTAMIRANO, GRO   21/FEBRERO/2012 

CONCLUSIÓN FINAL DE LA UNIDAD NUMERO 2


A manera de conclusión puedo decir que se cumplió con los objetivos planteados de la segunda unidad, ya que en lo personal, reafirme y me enriquecí un poco mas acerca del conocimiento de los ácidos nucleicos a nivel físico y químico para a futuro llevar a cabo su manipulación. Aprendí todo acerca de sus características físicas, y químicas que estos presentan, como están formados, y que es lo que contienen, de igual manera adquirí los conocimientos sobre las funciones que estas moléculas desempeñan y la importancia que estas conllevan.
Así como también, observe, practique y describí con detalle la estructura de las moléculas que participan en la transferencia de información de los ácidos nucleicos a manera de una maqueta que realizamos en clase.
Con los problemas que me presente en esta unidad, fue más que nada en elaborar la maqueta de la estructura del nucleotido del ARN, puesto que con el material que lo elaborábamos no ensamblaba bien, pero con paciencia, resulto el trabajo. Y para describir la estructura y poder elaborarla en manera escrita, debo de estudiarla y comprenderla. Los objetivos a futuro que plasmo serian, poder comprender bien, y más a fondo las funciones de los ácidos nucleicos, ya que en las unidades próximas seguiremos trabajando con estas moléculas, ya que son esenciales en el aprendizaje del curso de Biología Molecular.

viernes, 10 de febrero de 2012

OBJETIVOS DE LA "2 UNIDAD"


A) Reafirmar y enriquecer el conocimiento de los ácidos nucleicos a nivel químico para su manipulación.

B) Observar y describir con detalle la estructura de las moléculas que participan en la transferencia de información.

METODOLOGÍA

La metodología que utilizare en mi portafolio de evidencias de trabajo, así como mis tareas, resumen de las clases, e investigaciones. Serán conforme a los días de clases.
Por ejemplo un día Lunes en la clase el profesor nos habla de la estructura del ADN, y en ese mismo día por la tarde subiré información sobre el tema visto en clase.
Cuando el profesor, programe una fecha para entregar un trabajo de investigación, y se llegue el día mencionado, subiré mi trabajo realizado.
Cuando el profesor, nos deje algún ejercicio en clase, tomare evidencias "Fotografias" Para tenerla vista en mi perfil, y así mismo comprobar mis trabajos. De igual  manera serán los exámenes aplicados.
Ahora bien, la metodología que utilizare para poder aprobar la segunda unidad con una buena nota; serán Primeramente, asistir a todas las clase, y sin llegar tarde, prestar atención, cualquier duda o pregunta que tenga, preguntársela al profesor. Cuando deje un trabajo de investigación, revisaré diferentes bibliografías actuales para presentar un buen trabajo. También si es necesario discutiré la información encontrada con mis compañeros de clase, o con el profesor.Realizare esquemas o cuadros sinopticos para poder entender a manera de dibujos los conocimientos adquiridos.
                                                                              
                                                                         EVIDENCIAS

           

                              Examen de la primera Unidad "Introducción a la Biología Molecular"
En el primer examen no alcance la nota que hubiera deseado, me falto leer y aprender un poco más sobre "El descubrimiento del código genético" Viendo en lo que me fallo me propuse a entender más sobre el tema.

EVIDENCIAS


Nucleotido (Guanina-Citosina)
En el laboratorio realizamos un trabajo Manual, consistió en hacer algún Nucleotido del ADN o ARN, en este caso, realizamos Guanina- Citosina. Fue un poco laborioso puesto que los palillos no ensamblaban bien en las bolitas de unicel, pero a base de concentración nos resulto. Este trabajo nos ayudo, para ubicar mejor en que carbono se encuentra la base nitrogenada y el grupo fosfato, así como los puentes de hidrógeno.

miércoles, 8 de febrero de 2012

INTRODUCCIÓN


En la unidad numero 2 del curso de Biología Molecular; se hablara sobre la estructura química y física de los ácidos nucleicos; que son el ADN y ARN. En este punto se estudiara, se describirá, y se conocerán  todas aquellas características químicas y físicas que estas moléculas presentan, también se hablara sobre las funciones que presentan estas moléculas, cuales son, como son, y gracias a que son realizadas y la importancia de estos procesos. 

2.1.  ESTRUCTURA QUÍMICA Y FÍSICA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS: ADN Y ARN.

Características Químicas del ADN

Características Químicas ARN

Presentan un azúcar desoxirribosa

Presenta un azúcar Ribosa

Contiene un grupo fosfato

Contiene un grupo fosfato

Y una base nitrogenada

Y una base Nitrogenada

A.T.G.C

A.U.G.C


Características Físicas del ADN

Características Físicas del ARN

Doble Hélice

Cadena Sencilla

Anti paralela

Presenta diferentes formas

Las cadenas se unen por puentes de Hidrógeno de bases nitrogenadas                                              
Lineal:  ARNm

Helicoidales
Globular: ARNm

Dextrogira
Trébol: ARNt

Presenta surco mayor y surco menor

*Fosfatos: Proporciona el carácter eminentemente ácido del DNA y del RNA.
*Pentosas: Es el componente neutro, y sólo hay dos en los ácidos nucleicos                                                  
*Bases Nitrogenadas: Se encargan de darle la especificidad y el caracter básico a los ácidos nucleicos. Derivan del anillo de  pirimidina  o del doble anillo de  purin. 


                                                         ESTRUCTURA QUÍMICA
Compuesto sólo de cuatro moléculas básicas, llamadas nucleótidos, idénticas entre si, excepto que cada uno contiene una base nitrogenada diferente.
Cada nucleótido contiene:
·         Un grupo fosfato,
·         Un azúcar (desoxirribosa= para el ADN) y (ribosa= para el ARN),
·         Una de las cuatro bases (A,G,C,T= para el ADN) y (A,G,C,U= para el ARN)

En ausencia del grupo fosfato, la base y el azúcar forman un nucleósido, en vez de un nucleótido. 
Las cuatro bases del ADN son adenina, guanina, citosina y timina. Los nombres químicos completos son: 5´-monofosfato de desoxiadenosina, 5´-monofosfato de desoxiguanosina, 5´-monofosfato de desoxicitosina, 5´-monofosfato de desoxitimidina. Sin embargo corrientemente se refiere a cada nucleotido por la abreviatura de su base (A, G, C y T respectivamente). 
Dos de las bases, adenina y guanina son de estructura similar y se denomina purinas, las otras dos citosina y timina, también son similares y se denominan pirimidinas. 
Los ácidos nucleicos están constituidos entonces por la unión de numerosos nucleótidos. Cada nucleótido esta formado por un nucleósido y un fosfato (ácido) . El nucleósido está formado por una pentosa (neutro) y una base nitrogenada (básica).





                                            ESTRUCTURA FISICA

La doble hélice del ADN

La estructura que diseñaron Watson y Crick en 1953 es una doble hélice, cada hélice es una ristra de nucleótidos unidos por enlaces fosfodiester, en el que un grupo fosfato forma un puente entre grupos –OH de dos residuos de azúcar adyacentes. 
Las dos hélices se mantienen juntas mediante puentes de hidrógeno. Los puentes de hidrogeno se dan entre átomos de hidrógeno con una pequeña carga positiva y átomos con pequeña carga negativa.
Watson y Crick demostraron que solo estos emparejamientos poseen la complementariedad necesaria tipo “llave-cerradura”, para que permitiera la formación de puentes de hidrogeno.
El par G-C forma 3 puentes de hidrogeno, mientras que el par A-T solo dos. Se predijo que el DNA que tuviera  muchos pares G-C seria más estable que el DNA con muchos pares A-T, y de hecho esta predicción fue confirmada.

Otras Estructuras
Las estructuras más frecuentes y fisiológicas en las que se puede encontrar el DNA es en forma de DNA-B (la propuesta de Watson y Crick), en forma de DNA-A (cuando está deshidratado o hibridado con RNA) y DNA-Z (cuando es levógiro).
                                          
Características de las formas del ADN
Características del DNA-B

Características del DNA-A (También llamado RNA 11)

Giro de la hélice: Dextrógiro
Diámetro de la hélice: 2,37 nm
Del diámetro, 1,1 nm corresponde al par de bases .
Vuelta completa: (Paso de rosca, pitch): 3,54 nm
Nucleótidos por vuelta: 10,4 pb (Watson y Crick propusieron 10)
Separación entre las bases (elevación o rise): 0,34 nm (3,54 / 10,4 = 0,34), que además coincide con el tamaño de van der Waals para un anillo plano.


Giro de la hélice: Dextrógiro
Diámetro de la hélice: 2,55 nm
Del diámetro, 1,1 nm corresponden al par de bases, pero no se sitúan sobre el eje como en el DNA-B, dejando un hueco central en el que puede entrar el agua.
Vuelta completa: (Paso de rosca, pitch) 2,53 nm
Nucleótidos por vuelta: 11 pb (de aquí el nombre de DNA-11)



2.2 FUNCIÓN DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS.
El dogma central de la Biologia Molecular
Fue Francis Crick quien introdujo el dogma central de la Biología Molecular parar describir el flujo de información biológica y cómo la célula utiliza esa información. 

                         
                                 

Implicaciones biológicas de la estructura del DNA
Esta estructura del DNA causó gran excitación entre los genetistas y en todas las áreas de la biología, por 2 razones fundamentales:

1. La estructura sugería una forma obvia por la que la molécula puede ser duplicada o replicada, ya que cada base determina su complementaria mediante puentes de hidrogeno.

2. La estructura hace pensar que quizá la secuencia de pares de bases en el DNA es la que determina la secuencia de aminoácidos de la proteína dictada por un gen. En otras palabras, algún tipo de código genético podría escribir información en el DNA con una secuencia de pares de nucleótidos.

3. Por iguales razones la estructura guarda y trasmite la información genética.


Funciones ARN
Funciones ADN
ARNm: Informativo; Llevar la información del ADN a los ribosomas para producir proteínas
ARNr: Se encarga de unir los aminoácidos en proteínas con la información del ARNm
ARNt: Transportar los aminoácidos al Ribosoma
ARNsn: Corta los intrones y exones en ARNm inmaduro en el núcleo.
ARNsc: Ayuda en el transporte de proteínas en el citoplasma dentro de la célula 
Contiene y guarda el material genético, guarda la información genética
Copia y replica la información, se copia así mismo
Controla el metabolismo de la Célula.

UNIDAD NUMERO 2: ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DEL MATERIAL GENÉTICO


"PORTADA"


SEP                      SNEST                      DGEST


INSTITUTO TECNOLÓGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO



UNIDAD NUMERO 2
"ESTRUCTURA Y PROPIEDADES DEL MATERIAL GENÉTICO"

QUE PRESENTA LA ALUMNA:
ALEXA MOLINA VALENZUELA
09930047

LIC: EN BIOLOGÍA
Vl SEMESTRE "A"

NOMBRE DEL PROFESOR:
FRANCISCO JAVIER PUCHE ACOSTA


CIUDAD ALTAMIRANO, GUERRERO, MEXICO. FEBRERO DEL 2012